1990-ben indult el máig tartó, első testvériskolai kapcsolatunk a baróti Gaál Mózes Általános Iskolával (Románia, Erdély, Kovászna megye). A személyes ismeretségből kialakult együttműködés változatos formában valósult meg: nyári tábor erdélyi gyerekekkel a Balaton-parton, iskolánk tanulóinak baróti táborozása, a baróti énekkar bemutatkozása Pápán, kollégák szakmai látogatásai mindkét településen, kölcsönös részvétel az iskolák által szervezett sportversenyeken.  

2000-től indult másik testvériskolai kapcsolatunk a schwetzingeni Hildaschule-val (Németország). Ezt a kapcsolatot a Jókai Mór Általános Iskola építette ki, a Weöres iskola pedig továbbvitte. A testvériskolai kapcsolat során kétévente a német gyerekek egy csoportja, illetve tanulóink egy csoportja látogat egy hétre a másik intézménybe.


2006-tól iskolánkban bevezetett Arizona-programot ebből az iskolából adaptáltuk.

2015-től megszűnt a kapcsolatunk a schwetzingeni Hildaschule-val (Németország). Jelenleg az új partneriskolánk Karl-Friedrich-Schimper Gemeinschaftsschule, Schwetzingen.